« C’est toujours une science largement descriptive », note Lipkin. La seule certitude: certains microbes sont associés à certaines conditions.
Cet avertissement mis à part, Lipkin attend avec impatience où mènera la science du microbiote. Il espère que les scientifiques comprendront dans les cinq à dix ans, ce qui est mécanisme que le microbiote influence le corps et que les essais cliniques sur l’homme auront commencé à montrer l’effet d’un microbiote altéré sur notre santé. Que la science du microbiote « sera devenue mécanique et testable, dit W. Ian Lipkin, alors elle deviendra réelle.» »
Dans les pays développés, la grande majorité des adolescents sont soumis à des boutons. Pour eux, il semble qu’il y ait un « microbiote d’acné ». De nombreux adolescents ont des peaux particulièrement accueillantes pour deux variétés de Cutibacterium acnes (à savoir Propionibacterium acnes) étroitement lié à l’acné.
Malgré la présence du mot «acné» dans sa dénomination, la plupart des souches de ces bactéries sont des microbes pathogènes en mouvement inoffensifs ou bénéfiques. C. ACNES est le composant principal du microbiote normal du visage et du cou. Mais une variété nocive de C. ACNES peut être un problème. Ceci est l’un des déclencheurs de l’acné, spécifie Amanda Nelson, chercheuse à la Faculté de médecine de la Pennsylvania State University.
Des chercheurs de la Faculté de médecine de l’Université de Washington de Saint Louis ont étudié le microbiote d’acné. Ils ont découvert que le seul traitement offrant une rémission durable, l’isotrétinoïne, fonctionne en partie en modifiant le microbiote de la peau. Il réduit le nombre de bactéries C. ACNES Tout en augmentant la diversité du microbiote cutané.
Sachant cela, les scientifiques pourraient essayer de concevoir les traitements microbiens ayant le même effet. Mais, ils espèrent, des traitements plus sûrs que l’isotrétinoïne, ce qui peut provoquer des malformations congénitales si elle est prise pendant la grossesse.
Parmi ces nouveaux remèdes possibles figurent ce que les chercheurs de l’Université de Washington appellent des «engrais prébiotiques» (c’est-à-dire des microbes qui établissent les conditions d’un microbiote cutané sain) et du «désherbage sélectif» (qui élimine les souches nocives des souches nocives C. ACNESmais économisez les souches bénéfiques). Ils ajoutent que l’on pourrait également introduire dans le mélange de probiotiques – une supplémentation orale ou locale contenant des doses de souches bénéfiques de Cutibacterium.
Et si vos exercices physiques vous appréciaient davantage simplement en transférant des microbes du gros intestin d’un athlète à la vôtre? Chaque jour, pendant deux semaines, les scientifiques de Harvard ont prélevé des échantillons de quinze coureurs du marathon de Boston. Ils ont commencé une semaine avant la course et ont arrêté une semaine plus tard. Ensuite, ils les ont comparés à des échantillons de selles prélevées pendant deux semaines sur un groupe de témoins de dix non-coureurs. Quelques jours après le marathon, bactéries Veillonella atypica étaient beaucoup plus nombreux dans les tabourets des coureurs que dans ceux des non-cours.
« C’était une sorte de révélation, en raison du métabolisme unique de Veillonelladont le lactate est la source d’énergie préférée », explique Aleksandar Kostic, le Joslin Center sur le diabète et la Faculté de médecine de Harvard. Les muscles génèrent du lactate pendant un exercice intense. « Cela nous a fait penser: et si Veillonella Lactate métabolisé d’origine musculaire chez les athlètes? »Et, si tel était le cas, les inoculations de Veillonella Pourraient-ils aider les non-athlètes à améliorer leurs performances?
Des chercheurs ont extrait de Veillonella Diapositives d’un coureur pour les inoculer à seize souris dans le microbiote normal et après le dépistage des agents pathogènes. Ils ont placé les souris sur de minuscules tapis roulants et les ont fait courir jusqu’à l’épuisement. Ils ont fait de même avec seize témoins, en inoculant une autre bactérie de leur part, non lié au métabolisme du lactate.
Souris transportant Veillonella a couru 13% plus long que les souris témoins. Conclusion des chercheurs: Le rôle du microbiote peut être crucial dans les performances physiques.
L’expérience offre « un exemple très subtil de la façon dont une symbiose se produit », explique Aleksandar Kostic. Ce genre de relations, je pense, sous-tend la plupart des relations entre les humains et les microbes. En fin de compte, c’est ce type de relation mutualiste qui se produit. »»
Le microbiote peut également expliquer certains phénomènes moins positifs – notamment des états mentaux tels que l’anxiété et la dépression. En 2016, des scientifiques du Cork University College ont publié un article prouvant le lien entre le microbiote et la dépression.
Pour ce faire, ils avaient transplanté des selles d’humains déprimés chez le rat. Vingt-huit rongeurs ont été divisés en deux groupes. Les rats du groupe expérimental ont reçu des excréments d’un mélange de préparations de trois hommes gravement déprimés. Les rats témoins ont reçu des transplantations d’un mélange d’excréments de trois hommes en bonne santé.
Il s’est avéré que les transplantations fécales des hommes déprimés ont également déprimé les rats du premier groupe. Par rapport aux rats témoins, ils ont démontré une perte d’intérêt pour les activités agréables et une anxiété accrue. Il y a loin du rat à l’être humain, admettez les scientifiques. Mais ils affirment que leur travail confirme la thèse selon laquelle le microbiote du gros intestin pourrait jouer un rôle dans le développement de la dépression. Et que le ciblage de ces micro-organismes pourrait un jour aider à traiter la dépression et d’autres troubles de l’humeur.
Le microbiote est à la fois constant et en constante évolution. Votre profil microbiologique unique est à peu près établi à partir de l’âge de 4 ans. Seuls les changements importants (modifier votre alimentation ou vos habitudes d’exercice physique, se déplacer, passer moins de temps à l’extérieur, prendre des antibiotiques ou certains autres médicaments) peuvent vraiment le modifier.
En parallèle, le microbiote évolue constamment, variant de manière minimale à chaque repas. Tout au long de l’âge adulte, il change selon un cours prévisible qui peut être estimé votre âge grâce à l’examen de votre flore intestinale.
Comme le start-up Insilico Medicine l’a récemment démontré, basé à Hong Kong, l’intelligence artificielle vous permet de lire cette « horloge microbiotique du vieillissement ». Ses chercheurs ont collecté des informations sur les microbiotas de 1 165 habitants d’Europe, d’Asie et d’Amérique du Nord, à partir de jeux de données d’accès gratuit. Environ un tiers des échantillons provenaient de personnes âgées de 20 à 40 ans, d’un tiers de quarante ans -old et cinquante ans -olds, et un tiers des personnes âgées de 60 à 90 ans.
Les scientifiques ont intégré 90% des sujets, classés par âge. Ensuite, ils ont appliqué les modèles trouvés par l’intelligence artificielle à d’autres 10% du microbiote, non classées. Ils voulaient voir s’ils ont ainsi réussi à déterminer l’âge des hôtes initiaux de ces microbiote. L ‘«horloge microbiotique du vieillissement» a fourni des réponses exactes aux quatre années à près de quatre ans.
Qu’est-ce que cela nous dit sur les changements physiques qui se produisent avec l’âge en particulier, l’affaiblissement de l’immunité, l’inflammation systémique et la fragilité de notre organisme? À l’Institut Babraham de Cambridge, les chercheurs ont tenté de le découvrir en utilisant des transplantations fécales. Sachant que le système immunitaire fonctionne moins bien avec l’âge, ils se demandaient si la greffe des jeunes excréments de souris chez les vieilles souris aurait un effet reposant.
Avant la transplantation, des grappes de follicules (ou plaques de peyer) tapissant l’intestin grêle des vieilles souris avaient une baisse significative de la réaction immunitaire. Lorsque ces souris ont reçu des transplantations fécales de jeunes souris, la réponse immunitaire de leurs plaques de Peyer était celle des sujets plus jeunes. Il semble que les scientifiques ont conclu que le ralentissement de la réaction immunitaire observé chez les souris âgés est réversible. Il peut être «sauvé» en inoculant les microbes intestinaux de jeunes souris. Compte tenu de ces résultats, on se demande si une dose de « jeunes » tabourets pourrait être le secret de la vieillesse dépensée en meilleure santé.
La transplantation de la FÉCALE est une pratique courante dans la recherche sur les microbiotas animaux. C’est également l’une des principales interventions cliniques à l’étude chez l’homme. Il permettrait d’introduire des microbes dans nos intestins susceptibles de combattre un large éventail de maladies. Et ce n’est pas une simple spéculation.
La transplantation Fécale est utilisée depuis dix ans pour traiter l’infection récurrente à Clostridium difficileAntibioréSisting, qui provoque une infection intestinale grave et potentiellement mortelle. Selon Colleen Kelly, de Brown University, co-responsable des transplantations nationales de transplantation de microbiote Feccal aux États-Unis, entre 12 000 et 15 000 germes de tabourets sont effectués chaque année sous le contrôle médical de ce seul pays.
En général, les résultats sont bons. Mais, en juin dernier, l’agence de produits alimentaires et médicamenteux (FDA) a indiqué qu’un patient était décédé d’une infection à la suite d’une greffe. Cela avait été produit avec des selles qui n’ont pas fait l’objet d’un dépistage adéquat des bactéries résistantes aux médicaments.
En plus des transplantations fécales, les scientifiques envisagent d’autres méthodes pour manipuler notre microbiote. Ils étudient en particulier l’utilisation de prébiotiques et de probiotiques, ainsi que des changements dans l’alimentation ou les exercices physiques susceptibles de modifier la composition de cocktails microbiens présents dans le gros intestin.
Mais même les partisans les plus ardents de la microbiotique admettent qu’il est difficile de tirer des conclusions sur le lien entre le microbiote et la santé humaine, et conseille de ne pas se précipiter pour concevoir des traitements.
« La transplantation de Fécale et l’utilisation de microbiotas à des fins thérapeutiques suscitent beaucoup d’enthousiasme », observe Paul Wilmes, de l’Université du Luxembourg, notant que les entreprises travaillent sur de nouveaux probiotiques visant à « restaurer un microbiote, afin qu’il soit en panne avec son sien avec le sien avec son sien avec le sien avec son sien avec le sien avec son sien avec le sien avec son sien avec le sien avec son sien avec le sien avec le sien avec son sien avec le sien avec le sien avec le sien avec le sien avec le sien, hôte ».
« Avant de pouvoir y parvenir correctement et rationnellement », recommande-t-il, « nous devons comprendre ce que consiste vraiment un microbiote sain et quelles sont les fonctions conférées par des microbiotes à l’hôte humain. Je ne pense pas que nous soyons toujours là. » «
