Une avancée récente dans la recherche sur le cancer vient de l’Institut Garvan, où des scientifiques ont utilisé l’intelligence artificielle pour découvrir des éléments potentiellement cancérigènes dans des régions du génome autrefois considérées comme de l’« ADN poubelle ». Ces régions non codantes, qui constituent 98 % de notre ADN, pourraient transformer la façon dont nous traitons le cancer. diagnostic et le traitement de cancer.
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Les chercheurs ont publié leurs résultats dans la revue Recherche sur les acides nucléiquesmettant en évidence les mutations dans ces régions ignorées de la génome. Ces mutations seraient impliquées dans la formation et la progression de plusieurs cancers, dont ceux du prostatepoitrine et côlonCette découverte ouvre la voie à un diagnostic précoce et à de nouveaux traitements pour de nombreux types de cancer. La Dre Amanda Khoury, auteure principale de l’étude, explique que l’ADN non codant, autrefois considéré comme inutile, pourrait offrir une approche universelle pour traiter le cancer. En ciblant ces mutations courantes, les chercheurs espèrent développer des thérapies plus efficaces.
Les scientifiques se sont concentrés sur les sites de liaison de la protéine CTCF, qui jouent un rôle crucial dans l’organisation tridimensionnelle du génome. Leur perturbation pourrait entraîner une dérégulation des gènes et favoriser le développement du cancer. Pour tester cette hypothèse, ils ont utilisé une outil deapprentissage automatique appelé CTCF-INSITE pour prédire les sites de liaison CTCF persistants dans 12 types de cancer.
Grâce à cet outil, ils ont analysé plus de 3 000 échantillons de tumeurs, révélant que les sites de liaison du CTCF étaient riches en mutations dans tous les échantillons de cancer. Ces mutations donneraient aux cellules cancéreuses un avantage de survie, leur permettant de proliférer et de se propager.
La professeure Susan Clark, directrice du laboratoire d’épigénétique du cancer à l’Institut Garvan, estime que ces résultats pourraient avoir de vastes implications pour le traitement de nombreux cancers. Les traitements actuels doivent être adaptés à des mutations spécifiques, qui sont souvent rares dans différents types de tumeurs, mais les sites de liaison CTCF constituent une cible commune pour de nombreux cancers.
Les prochaines étapes de la recherche comprendront des expériences à grande échelle utilisant l’édition génétique La technologie CRISPR permet d’étudier comment ces mutations affectent la structure 3D du génome et favorisent potentiellement la croissance du cancer. Cette approche pourrait permettre de développer des biomarqueurs pour la détection précoce du cancer ou des cibles pour de nouveaux traitements.